Возможный объем переработки составляет до 3 млн тн В качестве сырья используется малозернистая нефть и газоконденсат. Существующая схема переработки сырья позволит производить только неглубокую переработку. Продуктами переработки являются прямогонные бензиновая и дизельная фракция, мазут и получаемая на установке ГФУ сжиженная пропанобутановая смесь. Несобранные газы направляются в топливную систему завода. Вся выпускаемая заводом продукция, соответствует показателям нормативной документации.

Афипский НПЗ является производителем бензиновых фракции (А-1, П-1), дизельного топлива (Л-0,2-62) и мазута (М-40).

На внутренний рынок поставляется примерно 30% общего объема производства. Основным видом продукции, реализуемым на внутреннем рынке, является дизельное топливо.

Остальной объем производимой продукции поставляется на экспорт. Основными экспортными продуктами являются бензин экспортный технологический и мазут. Экспорт нефтепродуктов осуществляется через нефтеперевалочные комплексы морских портов ЮФО: Новороссийск и Туапсе, Кавказ. Основными экспортными направлениями являются Роттердам, Турция, Греция.